Perteneciente a Gipuzkoa y enclavada estratégicamente entre Bizkaia y Alava, Leintz Gatzaga se asienta en el Valle de Leniz, en la comarca del Alto Deba, centro geográfico de Euskadi.
Cercana a zonas, industriales como Arrasate o Aretxabaleta, limita al norte con Eskoriatza, y al sur se encuentran los municipios alaveses de Legutiano, Arruazua-Ubarrundia y Barrundia, pertenecientes al Territorio Histórico de Alava.
Sus lindes territoriales abarcan una extensión de 14,7 kilómetros cuadrados caracterizados por un perfil sinuoso y montañoso con una vegetación predominantemente boscosa.
El casco urbano se alza sobre una empinada ladera que antiguamente era surcada por el Camino Real que comunicaba Madrid con el mar.
